Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms