Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ABCC1P33527 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms