Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms