Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms