Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms