Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO1P25800 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO1P25800 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO1P25800 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO1P25800 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO1P25800 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO1P25800 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO1P25800 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO1P25800 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO1P25800 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO1P25800 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO1P25800 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO1P25800 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO1P25800 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO1P25800 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO1P25800 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO1P25800 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO1P25800 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO1P25800 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO1P25800 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO1P25800 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO1P25800 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO1P25800 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO1P25800 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO1P25800 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO1P25800 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO1P25800 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO1P25800 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO1P25800 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO1P25800 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO1P25800 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO1P25800 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO1P25800 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO1P25800 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO1P25800 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO1P25800 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO1P25800 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO1P25800 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO1P25800 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO1P25800 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO1P25800 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO1P25800 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO1P25800 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO1P25800 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO1P25800 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO1P25800 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO1P25800 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO1P25800 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO1P25800 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO1P25800 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO1P25800 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO1P25800 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO1P25800 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO1P25800 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO1P25800 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO1P25800 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO1P25800 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO1P25800 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO1P25800 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO1P25800 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO1P25800 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO1P25800 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO1P25800 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO1P25800 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO1P25800 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO1P25800 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO1P25800 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO1P25800 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO1P25800 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO1P25800 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO1P25800 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO1P25800 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO1P25800 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO1P25800 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO1P25800 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO1P25800 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO1P25800 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO1P25800 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO1P25800 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO1P25800 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO1P25800 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO1P25800 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO1P25800 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO1P25800 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO1P25800 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO1P25800 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO1P25800 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO1P25800 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO1P25800 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO1P25800 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO1P25800 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO1P25800 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO1P25800 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO1P25800 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO1P25800 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO1P25800 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO1P25800 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO1P25800 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO1P25800 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO1P25800 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms