Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms