Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PTPRGP23470 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC33.82■■■■□ 3
PTPRGP23470 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC33.82■■■■□ 3
PTPRGP23470 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PTPRGP23470 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PTPRGP23470 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PTPRGP23470 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PTPRGP23470 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
PTPRGP23470 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PTPRGP23470 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PTPRGP23470 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PTPRGP23470 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PTPRGP23470 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC33.81■■■■□ 3
PTPRGP23470 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PTPRGP23470 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PTPRGP23470 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC33.8■■■■□ 3
PTPRGP23470 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PTPRGP23470 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
PTPRGP23470 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PTPRGP23470 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PTPRGP23470 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PTPRGP23470 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRGP23470 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRGP23470 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRGP23470 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PTPRGP23470 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRGP23470 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRGP23470 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRGP23470 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRGP23470 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRGP23470 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PTPRGP23470 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRGP23470 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRGP23470 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PTPRGP23470 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC33.78■■■■□ 3
PTPRGP23470 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRGP23470 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRGP23470 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRGP23470 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRGP23470 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRGP23470 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRGP23470 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
PTPRGP23470 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PTPRGP23470 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PTPRGP23470 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PTPRGP23470 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PTPRGP23470 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PTPRGP23470 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PTPRGP23470 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PTPRGP23470 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PTPRGP23470 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
PTPRGP23470 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PTPRGP23470 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PTPRGP23470 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PTPRGP23470 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC33.77■■■■□ 3
PTPRGP23470 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PTPRGP23470 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PTPRGP23470 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PTPRGP23470 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
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