Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME2P23368 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME2P23368 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ME2P23368 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME2P23368 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME2P23368 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME2P23368 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME2P23368 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME2P23368 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME2P23368 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME2P23368 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME2P23368 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME2P23368 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME2P23368 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME2P23368 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME2P23368 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME2P23368 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME2P23368 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME2P23368 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME2P23368 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME2P23368 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME2P23368 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME2P23368 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME2P23368 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME2P23368 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME2P23368 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME2P23368 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME2P23368 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME2P23368 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME2P23368 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME2P23368 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME2P23368 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME2P23368 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME2P23368 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME2P23368 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ME2P23368 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ME2P23368 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ME2P23368 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ME2P23368 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ME2P23368 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ME2P23368 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ME2P23368 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ME2P23368 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ME2P23368 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ME2P23368 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME2P23368 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME2P23368 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME2P23368 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME2P23368 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME2P23368 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME2P23368 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME2P23368 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME2P23368 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME2P23368 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME2P23368 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ME2P23368 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME2P23368 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME2P23368 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME2P23368 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME2P23368 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME2P23368 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME2P23368 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME2P23368 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME2P23368 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME2P23368 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME2P23368 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ME2P23368 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME2P23368 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME2P23368 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME2P23368 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ME2P23368 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME2P23368 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME2P23368 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME2P23368 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ME2P23368 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME2P23368 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME2P23368 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME2P23368 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME2P23368 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME2P23368 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME2P23368 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME2P23368 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME2P23368 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME2P23368 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME2P23368 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME2P23368 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME2P23368 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME2P23368 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME2P23368 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME2P23368 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME2P23368 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME2P23368 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME2P23368 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME2P23368 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME2P23368 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME2P23368 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME2P23368 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME2P23368 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME2P23368 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME2P23368 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms