Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPAP23025 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPAP23025 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPAP23025 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPAP23025 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPAP23025 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPAP23025 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPAP23025 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPAP23025 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPAP23025 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPAP23025 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPAP23025 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPAP23025 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPAP23025 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPAP23025 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPAP23025 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPAP23025 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPAP23025 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPAP23025 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPAP23025 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPAP23025 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPAP23025 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPAP23025 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPAP23025 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPAP23025 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
XPAP23025 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPAP23025 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPAP23025 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPAP23025 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPAP23025 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPAP23025 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPAP23025 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPAP23025 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPAP23025 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPAP23025 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPAP23025 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPAP23025 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
XPAP23025 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPAP23025 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPAP23025 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPAP23025 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPAP23025 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPAP23025 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPAP23025 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPAP23025 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPAP23025 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPAP23025 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPAP23025 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPAP23025 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPAP23025 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPAP23025 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPAP23025 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPAP23025 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPAP23025 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPAP23025 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPAP23025 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPAP23025 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPAP23025 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPAP23025 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
XPAP23025 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPAP23025 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPAP23025 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPAP23025 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPAP23025 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPAP23025 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPAP23025 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPAP23025 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPAP23025 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPAP23025 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPAP23025 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPAP23025 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPAP23025 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPAP23025 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPAP23025 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPAP23025 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPAP23025 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPAP23025 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPAP23025 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPAP23025 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
XPAP23025 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPAP23025 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPAP23025 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPAP23025 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
XPAP23025 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
XPAP23025 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
XPAP23025 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
XPAP23025 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
XPAP23025 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XPAP23025 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
XPAP23025 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
XPAP23025 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XPAP23025 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XPAP23025 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XPAP23025 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
XPAP23025 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
XPAP23025 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.32■■□□□ 1
XPAP23025 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XPAP23025 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
XPAP23025 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XPAP23025 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms