Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms