Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASTP20810 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASTP20810 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASTP20810 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASTP20810 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASTP20810 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASTP20810 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASTP20810 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASTP20810 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASTP20810 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASTP20810 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASTP20810 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASTP20810 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASTP20810 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASTP20810 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASTP20810 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASTP20810 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASTP20810 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASTP20810 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASTP20810 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASTP20810 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASTP20810 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASTP20810 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASTP20810 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASTP20810 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASTP20810 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASTP20810 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASTP20810 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASTP20810 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASTP20810 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASTP20810 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASTP20810 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASTP20810 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASTP20810 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASTP20810 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASTP20810 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CASTP20810 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASTP20810 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASTP20810 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASTP20810 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASTP20810 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASTP20810 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASTP20810 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASTP20810 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASTP20810 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASTP20810 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASTP20810 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASTP20810 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASTP20810 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASTP20810 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASTP20810 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASTP20810 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASTP20810 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CASTP20810 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASTP20810 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASTP20810 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASTP20810 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASTP20810 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CASTP20810 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASTP20810 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASTP20810 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASTP20810 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASTP20810 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASTP20810 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASTP20810 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASTP20810 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASTP20810 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASTP20810 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASTP20810 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASTP20810 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASTP20810 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASTP20810 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASTP20810 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASTP20810 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASTP20810 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASTP20810 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASTP20810 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASTP20810 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASTP20810 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASTP20810 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CASTP20810 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASTP20810 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASTP20810 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASTP20810 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASTP20810 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASTP20810 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASTP20810 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASTP20810 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASTP20810 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASTP20810 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASTP20810 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASTP20810 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASTP20810 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CASTP20810 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CASTP20810 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASTP20810 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASTP20810 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASTP20810 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASTP20810 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASTP20810 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms