Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AMY2BP19961 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AMY2BP19961 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AMY2BP19961 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AMY2BP19961 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AMY2BP19961 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AMY2BP19961 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AMY2BP19961 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMY2BP19961 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMY2BP19961 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMY2BP19961 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMY2BP19961 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMY2BP19961 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMY2BP19961 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMY2BP19961 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMY2BP19961 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMY2BP19961 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMY2BP19961 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMY2BP19961 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMY2BP19961 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMY2BP19961 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms