Protein–RNA interactions for Protein: P19623

SRM, Spermidine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRMP19623 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SRMP19623 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRMP19623 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRMP19623 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRMP19623 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRMP19623 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRMP19623 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRMP19623 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRMP19623 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRMP19623 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRMP19623 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRMP19623 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRMP19623 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRMP19623 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRMP19623 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRMP19623 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRMP19623 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRMP19623 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRMP19623 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRMP19623 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SRMP19623 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRMP19623 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRMP19623 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRMP19623 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRMP19623 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRMP19623 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRMP19623 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRMP19623 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRMP19623 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRMP19623 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRMP19623 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRMP19623 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRMP19623 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRMP19623 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRMP19623 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRMP19623 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRMP19623 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRMP19623 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRMP19623 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRMP19623 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRMP19623 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SRMP19623 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SRMP19623 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRMP19623 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SRMP19623 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SRMP19623 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRMP19623 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRMP19623 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRMP19623 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRMP19623 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRMP19623 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRMP19623 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRMP19623 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRMP19623 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRMP19623 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRMP19623 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRMP19623 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRMP19623 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRMP19623 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRMP19623 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRMP19623 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRMP19623 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRMP19623 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRMP19623 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRMP19623 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRMP19623 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRMP19623 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRMP19623 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRMP19623 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRMP19623 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRMP19623 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRMP19623 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRMP19623 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRMP19623 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRMP19623 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRMP19623 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRMP19623 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRMP19623 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRMP19623 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SRMP19623 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRMP19623 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRMP19623 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRMP19623 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRMP19623 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SRMP19623 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRMP19623 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRMP19623 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRMP19623 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRMP19623 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRMP19623 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRMP19623 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRMP19623 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRMP19623 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRMP19623 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRMP19623 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRMP19623 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRMP19623 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRMP19623 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRMP19623 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRMP19623 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms