Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCP1P17987 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCP1P17987 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCP1P17987 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCP1P17987 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCP1P17987 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCP1P17987 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCP1P17987 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCP1P17987 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCP1P17987 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCP1P17987 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCP1P17987 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TCP1P17987 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCP1P17987 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCP1P17987 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCP1P17987 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCP1P17987 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCP1P17987 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCP1P17987 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCP1P17987 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCP1P17987 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCP1P17987 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCP1P17987 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCP1P17987 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCP1P17987 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TCP1P17987 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCP1P17987 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCP1P17987 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCP1P17987 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCP1P17987 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCP1P17987 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCP1P17987 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCP1P17987 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCP1P17987 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TCP1P17987 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCP1P17987 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCP1P17987 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCP1P17987 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCP1P17987 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCP1P17987 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCP1P17987 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCP1P17987 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCP1P17987 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCP1P17987 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCP1P17987 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCP1P17987 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCP1P17987 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCP1P17987 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCP1P17987 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCP1P17987 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TCP1P17987 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TCP1P17987 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCP1P17987 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCP1P17987 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCP1P17987 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCP1P17987 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCP1P17987 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCP1P17987 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCP1P17987 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCP1P17987 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCP1P17987 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCP1P17987 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCP1P17987 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCP1P17987 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCP1P17987 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCP1P17987 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCP1P17987 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCP1P17987 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCP1P17987 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCP1P17987 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCP1P17987 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCP1P17987 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCP1P17987 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCP1P17987 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCP1P17987 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCP1P17987 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TCP1P17987 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCP1P17987 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCP1P17987 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCP1P17987 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCP1P17987 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCP1P17987 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCP1P17987 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCP1P17987 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCP1P17987 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCP1P17987 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCP1P17987 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCP1P17987 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCP1P17987 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCP1P17987 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCP1P17987 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCP1P17987 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCP1P17987 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCP1P17987 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCP1P17987 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TCP1P17987 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCP1P17987 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCP1P17987 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCP1P17987 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCP1P17987 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms