Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms