Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms