Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPA1P15085 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPA1P15085 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPA1P15085 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPA1P15085 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPA1P15085 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPA1P15085 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPA1P15085 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPA1P15085 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPA1P15085 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPA1P15085 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPA1P15085 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPA1P15085 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPA1P15085 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPA1P15085 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPA1P15085 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPA1P15085 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPA1P15085 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPA1P15085 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPA1P15085 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPA1P15085 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CPA1P15085 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPA1P15085 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CPA1P15085 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPA1P15085 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPA1P15085 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPA1P15085 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPA1P15085 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPA1P15085 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPA1P15085 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPA1P15085 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPA1P15085 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPA1P15085 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CPA1P15085 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CPA1P15085 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPA1P15085 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPA1P15085 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPA1P15085 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPA1P15085 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPA1P15085 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPA1P15085 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CPA1P15085 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CPA1P15085 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CPA1P15085 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CPA1P15085 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPA1P15085 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPA1P15085 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPA1P15085 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPA1P15085 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPA1P15085 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPA1P15085 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPA1P15085 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPA1P15085 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPA1P15085 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPA1P15085 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPA1P15085 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPA1P15085 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPA1P15085 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPA1P15085 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPA1P15085 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPA1P15085 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPA1P15085 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPA1P15085 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPA1P15085 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPA1P15085 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPA1P15085 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPA1P15085 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPA1P15085 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CPA1P15085 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPA1P15085 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPA1P15085 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPA1P15085 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPA1P15085 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPA1P15085 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPA1P15085 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPA1P15085 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPA1P15085 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPA1P15085 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPA1P15085 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPA1P15085 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPA1P15085 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPA1P15085 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPA1P15085 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPA1P15085 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPA1P15085 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPA1P15085 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPA1P15085 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPA1P15085 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPA1P15085 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPA1P15085 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPA1P15085 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPA1P15085 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPA1P15085 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPA1P15085 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPA1P15085 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPA1P15085 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPA1P15085 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPA1P15085 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPA1P15085 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CPA1P15085 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms