Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRAFP15056 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRAFP15056 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRAFP15056 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRAFP15056 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRAFP15056 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRAFP15056 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRAFP15056 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRAFP15056 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BRAFP15056 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRAFP15056 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRAFP15056 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRAFP15056 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRAFP15056 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRAFP15056 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRAFP15056 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRAFP15056 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRAFP15056 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRAFP15056 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BRAFP15056 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRAFP15056 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRAFP15056 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRAFP15056 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRAFP15056 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRAFP15056 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRAFP15056 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRAFP15056 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRAFP15056 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRAFP15056 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRAFP15056 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRAFP15056 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRAFP15056 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRAFP15056 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRAFP15056 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BRAFP15056 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BRAFP15056 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRAFP15056 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRAFP15056 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRAFP15056 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRAFP15056 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRAFP15056 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
BRAFP15056 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
BRAFP15056 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRAFP15056 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRAFP15056 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRAFP15056 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRAFP15056 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRAFP15056 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BRAFP15056 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRAFP15056 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRAFP15056 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRAFP15056 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRAFP15056 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRAFP15056 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRAFP15056 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRAFP15056 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRAFP15056 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRAFP15056 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRAFP15056 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRAFP15056 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRAFP15056 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRAFP15056 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRAFP15056 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRAFP15056 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BRAFP15056 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BRAFP15056 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BRAFP15056 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRAFP15056 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BRAFP15056 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRAFP15056 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRAFP15056 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BRAFP15056 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRAFP15056 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRAFP15056 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRAFP15056 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRAFP15056 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRAFP15056 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRAFP15056 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRAFP15056 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BRAFP15056 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRAFP15056 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRAFP15056 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BRAFP15056 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BRAFP15056 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRAFP15056 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRAFP15056 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRAFP15056 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRAFP15056 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRAFP15056 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRAFP15056 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRAFP15056 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRAFP15056 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRAFP15056 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRAFP15056 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRAFP15056 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRAFP15056 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRAFP15056 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRAFP15056 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRAFP15056 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRAFP15056 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms