Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRF1P14222 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRF1P14222 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRF1P14222 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRF1P14222 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRF1P14222 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRF1P14222 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRF1P14222 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRF1P14222 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRF1P14222 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRF1P14222 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRF1P14222 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRF1P14222 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRF1P14222 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRF1P14222 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRF1P14222 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRF1P14222 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRF1P14222 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PRF1P14222 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRF1P14222 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRF1P14222 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRF1P14222 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PRF1P14222 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRF1P14222 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRF1P14222 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PRF1P14222 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRF1P14222 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRF1P14222 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRF1P14222 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRF1P14222 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRF1P14222 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRF1P14222 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRF1P14222 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRF1P14222 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRF1P14222 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRF1P14222 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PRF1P14222 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRF1P14222 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRF1P14222 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRF1P14222 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PRF1P14222 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRF1P14222 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRF1P14222 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PRF1P14222 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRF1P14222 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRF1P14222 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRF1P14222 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PRF1P14222 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRF1P14222 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRF1P14222 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRF1P14222 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRF1P14222 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRF1P14222 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRF1P14222 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRF1P14222 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRF1P14222 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRF1P14222 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRF1P14222 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRF1P14222 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRF1P14222 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PRF1P14222 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRF1P14222 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRF1P14222 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRF1P14222 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRF1P14222 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRF1P14222 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PRF1P14222 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRF1P14222 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRF1P14222 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRF1P14222 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRF1P14222 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRF1P14222 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRF1P14222 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRF1P14222 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRF1P14222 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRF1P14222 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRF1P14222 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRF1P14222 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRF1P14222 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRF1P14222 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PRF1P14222 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PRF1P14222 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRF1P14222 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRF1P14222 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRF1P14222 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRF1P14222 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PRF1P14222 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRF1P14222 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRF1P14222 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRF1P14222 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRF1P14222 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRF1P14222 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRF1P14222 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PRF1P14222 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRF1P14222 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRF1P14222 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRF1P14222 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRF1P14222 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PRF1P14222 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRF1P14222 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms