Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms