Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CEACAM1P13688 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CEACAM1P13688 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms