Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms