Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms