Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYL1P12980 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYL1P12980 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYL1P12980 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYL1P12980 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYL1P12980 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYL1P12980 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYL1P12980 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYL1P12980 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYL1P12980 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYL1P12980 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LYL1P12980 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LYL1P12980 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LYL1P12980 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LYL1P12980 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LYL1P12980 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LYL1P12980 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LYL1P12980 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LYL1P12980 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LYL1P12980 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LYL1P12980 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LYL1P12980 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LYL1P12980 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LYL1P12980 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LYL1P12980 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LYL1P12980 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LYL1P12980 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LYL1P12980 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LYL1P12980 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LYL1P12980 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LYL1P12980 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LYL1P12980 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LYL1P12980 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LYL1P12980 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LYL1P12980 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LYL1P12980 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LYL1P12980 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LYL1P12980 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LYL1P12980 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LYL1P12980 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LYL1P12980 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LYL1P12980 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LYL1P12980 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LYL1P12980 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LYL1P12980 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LYL1P12980 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LYL1P12980 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LYL1P12980 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LYL1P12980 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LYL1P12980 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LYL1P12980 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LYL1P12980 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LYL1P12980 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LYL1P12980 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LYL1P12980 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LYL1P12980 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LYL1P12980 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LYL1P12980 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LYL1P12980 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LYL1P12980 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LYL1P12980 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LYL1P12980 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LYL1P12980 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LYL1P12980 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LYL1P12980 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LYL1P12980 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LYL1P12980 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LYL1P12980 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LYL1P12980 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LYL1P12980 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LYL1P12980 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LYL1P12980 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LYL1P12980 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LYL1P12980 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LYL1P12980 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LYL1P12980 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LYL1P12980 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LYL1P12980 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LYL1P12980 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LYL1P12980 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LYL1P12980 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LYL1P12980 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LYL1P12980 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LYL1P12980 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LYL1P12980 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LYL1P12980 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LYL1P12980 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LYL1P12980 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LYL1P12980 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LYL1P12980 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LYL1P12980 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LYL1P12980 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LYL1P12980 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LYL1P12980 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LYL1P12980 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LYL1P12980 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LYL1P12980 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LYL1P12980 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LYL1P12980 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LYL1P12980 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms