Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKBP12277 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKBP12277 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKBP12277 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKBP12277 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKBP12277 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKBP12277 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKBP12277 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CKBP12277 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKBP12277 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKBP12277 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKBP12277 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKBP12277 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CKBP12277 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKBP12277 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKBP12277 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CKBP12277 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CKBP12277 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKBP12277 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKBP12277 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKBP12277 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKBP12277 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKBP12277 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKBP12277 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKBP12277 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKBP12277 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKBP12277 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKBP12277 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKBP12277 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKBP12277 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKBP12277 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKBP12277 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CKBP12277 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKBP12277 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKBP12277 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKBP12277 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKBP12277 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKBP12277 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKBP12277 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKBP12277 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKBP12277 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKBP12277 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKBP12277 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKBP12277 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKBP12277 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKBP12277 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKBP12277 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CKBP12277 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKBP12277 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKBP12277 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKBP12277 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKBP12277 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKBP12277 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKBP12277 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKBP12277 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKBP12277 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CKBP12277 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKBP12277 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKBP12277 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKBP12277 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKBP12277 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKBP12277 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKBP12277 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKBP12277 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKBP12277 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CKBP12277 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKBP12277 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKBP12277 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKBP12277 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKBP12277 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKBP12277 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKBP12277 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKBP12277 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKBP12277 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CKBP12277 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKBP12277 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKBP12277 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKBP12277 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CKBP12277 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKBP12277 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKBP12277 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKBP12277 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKBP12277 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKBP12277 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKBP12277 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKBP12277 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKBP12277 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKBP12277 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKBP12277 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKBP12277 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CKBP12277 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CKBP12277 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKBP12277 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKBP12277 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKBP12277 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKBP12277 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKBP12277 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKBP12277 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKBP12277 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKBP12277 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms