Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFHP12036 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFHP12036 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFHP12036 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFHP12036 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFHP12036 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFHP12036 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFHP12036 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFHP12036 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFHP12036 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFHP12036 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFHP12036 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFHP12036 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFHP12036 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFHP12036 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFHP12036 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFHP12036 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFHP12036 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFHP12036 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFHP12036 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFHP12036 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFHP12036 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFHP12036 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEFHP12036 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEFHP12036 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEFHP12036 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEFHP12036 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEFHP12036 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEFHP12036 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEFHP12036 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEFHP12036 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEFHP12036 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEFHP12036 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEFHP12036 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEFHP12036 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEFHP12036 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEFHP12036 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFHP12036 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFHP12036 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFHP12036 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFHP12036 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFHP12036 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFHP12036 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFHP12036 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFHP12036 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFHP12036 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFHP12036 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFHP12036 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFHP12036 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFHP12036 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFHP12036 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFHP12036 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFHP12036 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFHP12036 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFHP12036 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFHP12036 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFHP12036 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFHP12036 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFHP12036 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFHP12036 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFHP12036 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFHP12036 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFHP12036 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFHP12036 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFHP12036 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFHP12036 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFHP12036 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFHP12036 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFHP12036 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFHP12036 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFHP12036 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFHP12036 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFHP12036 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFHP12036 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFHP12036 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFHP12036 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFHP12036 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFHP12036 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFHP12036 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFHP12036 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFHP12036 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFHP12036 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFHP12036 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFHP12036 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFHP12036 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFHP12036 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFHP12036 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFHP12036 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFHP12036 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFHP12036 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFHP12036 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFHP12036 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFHP12036 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFHP12036 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFHP12036 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFHP12036 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFHP12036 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFHP12036 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFHP12036 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFHP12036 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms