Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms