Protein–RNA interactions for Protein: P0DP25

CALM3, Calmodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM3P0DP25 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALM3P0DP25 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CALM3P0DP25 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALM3P0DP25 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CALM3P0DP25 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CALM3P0DP25 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALM3P0DP25 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms