Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C8orf89P0DMQ9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C8orf89P0DMQ9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
C8orf89P0DMQ9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C8orf89P0DMQ9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C8orf89P0DMQ9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C8orf89P0DMQ9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C8orf89P0DMQ9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C8orf89P0DMQ9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C8orf89P0DMQ9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C8orf89P0DMQ9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C8orf89P0DMQ9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C8orf89P0DMQ9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C8orf89P0DMQ9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms