Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM200BP0CF97 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms