Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms