Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTAP09496 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTAP09496 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTAP09496 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTAP09496 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTAP09496 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTAP09496 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTAP09496 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTAP09496 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTAP09496 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTAP09496 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTAP09496 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTAP09496 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTAP09496 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTAP09496 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTAP09496 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTAP09496 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTAP09496 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTAP09496 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTAP09496 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTAP09496 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTAP09496 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTAP09496 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTAP09496 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTAP09496 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTAP09496 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTAP09496 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTAP09496 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTAP09496 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTAP09496 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTAP09496 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTAP09496 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTAP09496 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTAP09496 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTAP09496 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTAP09496 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTAP09496 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLTAP09496 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CLTAP09496 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLTAP09496 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLTAP09496 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLTAP09496 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLTAP09496 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLTAP09496 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLTAP09496 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLTAP09496 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLTAP09496 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CLTAP09496 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLTAP09496 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLTAP09496 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLTAP09496 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLTAP09496 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLTAP09496 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLTAP09496 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLTAP09496 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CLTAP09496 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLTAP09496 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLTAP09496 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLTAP09496 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLTAP09496 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLTAP09496 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLTAP09496 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTAP09496 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTAP09496 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTAP09496 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTAP09496 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTAP09496 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTAP09496 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTAP09496 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTAP09496 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTAP09496 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTAP09496 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTAP09496 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTAP09496 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTAP09496 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTAP09496 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLTAP09496 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLTAP09496 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLTAP09496 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLTAP09496 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLTAP09496 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLTAP09496 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLTAP09496 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLTAP09496 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLTAP09496 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLTAP09496 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLTAP09496 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLTAP09496 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLTAP09496 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTAP09496 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTAP09496 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTAP09496 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTAP09496 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTAP09496 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTAP09496 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTAP09496 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTAP09496 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTAP09496 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTAP09496 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTAP09496 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms