Protein–RNA interactions for Protein: P08700

IL3, Interleukin-3, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3P08700 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IL3P08700 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IL3P08700 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IL3P08700 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IL3P08700 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IL3P08700 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IL3P08700 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IL3P08700 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IL3P08700 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IL3P08700 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IL3P08700 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IL3P08700 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IL3P08700 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IL3P08700 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IL3P08700 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IL3P08700 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IL3P08700 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IL3P08700 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IL3P08700 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IL3P08700 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IL3P08700 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IL3P08700 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IL3P08700 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IL3P08700 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IL3P08700 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IL3P08700 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IL3P08700 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IL3P08700 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IL3P08700 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IL3P08700 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IL3P08700 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IL3P08700 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IL3P08700 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IL3P08700 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IL3P08700 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IL3P08700 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IL3P08700 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IL3P08700 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IL3P08700 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IL3P08700 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IL3P08700 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IL3P08700 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IL3P08700 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IL3P08700 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IL3P08700 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IL3P08700 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IL3P08700 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IL3P08700 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IL3P08700 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IL3P08700 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IL3P08700 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IL3P08700 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IL3P08700 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IL3P08700 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IL3P08700 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IL3P08700 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IL3P08700 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IL3P08700 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IL3P08700 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IL3P08700 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IL3P08700 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IL3P08700 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IL3P08700 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IL3P08700 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IL3P08700 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IL3P08700 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IL3P08700 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IL3P08700 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IL3P08700 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IL3P08700 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IL3P08700 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IL3P08700 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IL3P08700 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IL3P08700 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IL3P08700 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IL3P08700 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IL3P08700 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IL3P08700 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IL3P08700 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IL3P08700 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IL3P08700 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IL3P08700 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IL3P08700 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IL3P08700 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IL3P08700 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IL3P08700 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IL3P08700 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IL3P08700 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IL3P08700 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IL3P08700 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IL3P08700 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IL3P08700 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IL3P08700 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IL3P08700 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IL3P08700 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IL3P08700 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IL3P08700 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IL3P08700 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IL3P08700 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IL3P08700 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms