Protein–RNA interactions for Protein: P08603

CFH, Complement factor H, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHP08603 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFHP08603 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFHP08603 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFHP08603 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFHP08603 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFHP08603 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFHP08603 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFHP08603 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFHP08603 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFHP08603 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFHP08603 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFHP08603 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFHP08603 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFHP08603 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFHP08603 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CFHP08603 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFHP08603 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFHP08603 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CFHP08603 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFHP08603 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFHP08603 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFHP08603 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CFHP08603 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFHP08603 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFHP08603 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CFHP08603 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFHP08603 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFHP08603 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFHP08603 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFHP08603 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFHP08603 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFHP08603 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFHP08603 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFHP08603 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFHP08603 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFHP08603 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFHP08603 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFHP08603 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFHP08603 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFHP08603 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFHP08603 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFHP08603 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFHP08603 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFHP08603 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFHP08603 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFHP08603 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFHP08603 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CFHP08603 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CFHP08603 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFHP08603 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFHP08603 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFHP08603 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFHP08603 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFHP08603 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFHP08603 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFHP08603 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFHP08603 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFHP08603 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFHP08603 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFHP08603 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFHP08603 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFHP08603 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFHP08603 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFHP08603 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFHP08603 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFHP08603 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFHP08603 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFHP08603 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFHP08603 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFHP08603 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFHP08603 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFHP08603 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFHP08603 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFHP08603 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFHP08603 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFHP08603 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFHP08603 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFHP08603 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFHP08603 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFHP08603 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFHP08603 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFHP08603 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFHP08603 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFHP08603 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFHP08603 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFHP08603 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFHP08603 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFHP08603 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFHP08603 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFHP08603 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CFHP08603 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CFHP08603 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFHP08603 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFHP08603 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFHP08603 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFHP08603 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFHP08603 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFHP08603 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFHP08603 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFHP08603 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms