Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB1P08034 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB1P08034 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB1P08034 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB1P08034 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB1P08034 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB1P08034 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB1P08034 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB1P08034 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB1P08034 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB1P08034 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB1P08034 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB1P08034 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB1P08034 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB1P08034 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB1P08034 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB1P08034 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB1P08034 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB1P08034 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB1P08034 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB1P08034 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB1P08034 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB1P08034 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB1P08034 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB1P08034 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB1P08034 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB1P08034 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB1P08034 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB1P08034 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB1P08034 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB1P08034 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB1P08034 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB1P08034 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB1P08034 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB1P08034 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB1P08034 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB1P08034 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB1P08034 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB1P08034 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB1P08034 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB1P08034 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB1P08034 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB1P08034 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB1P08034 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB1P08034 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB1P08034 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB1P08034 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB1P08034 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB1P08034 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB1P08034 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB1P08034 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB1P08034 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB1P08034 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB1P08034 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB1P08034 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB1P08034 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB1P08034 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB1P08034 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB1P08034 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB1P08034 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB1P08034 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB1P08034 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB1P08034 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB1P08034 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB1P08034 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB1P08034 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB1P08034 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB1P08034 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB1P08034 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB1P08034 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB1P08034 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB1P08034 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB1P08034 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB1P08034 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB1P08034 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB1P08034 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB1P08034 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB1P08034 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB1P08034 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB1P08034 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB1P08034 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB1P08034 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB1P08034 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB1P08034 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB1P08034 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GJB1P08034 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GJB1P08034 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB1P08034 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB1P08034 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB1P08034 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB1P08034 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB1P08034 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB1P08034 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB1P08034 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB1P08034 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB1P08034 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB1P08034 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB1P08034 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB1P08034 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB1P08034 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms