Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSLP07711 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSLP07711 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSLP07711 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSLP07711 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSLP07711 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSLP07711 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSLP07711 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSLP07711 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSLP07711 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSLP07711 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSLP07711 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSLP07711 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSLP07711 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSLP07711 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSLP07711 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSLP07711 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSLP07711 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSLP07711 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSLP07711 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSLP07711 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSLP07711 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSLP07711 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTSLP07711 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CTSLP07711 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSLP07711 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CTSLP07711 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSLP07711 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSLP07711 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CTSLP07711 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSLP07711 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CTSLP07711 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTSLP07711 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSLP07711 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSLP07711 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSLP07711 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSLP07711 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSLP07711 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSLP07711 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTSLP07711 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSLP07711 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CTSLP07711 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTSLP07711 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTSLP07711 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CTSLP07711 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CTSLP07711 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTSLP07711 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CTSLP07711 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CTSLP07711 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSLP07711 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSLP07711 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSLP07711 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTSLP07711 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSLP07711 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSLP07711 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSLP07711 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSLP07711 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSLP07711 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSLP07711 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CTSLP07711 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CTSLP07711 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CTSLP07711 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CTSLP07711 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CTSLP07711 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTSLP07711 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTSLP07711 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTSLP07711 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTSLP07711 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CTSLP07711 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSLP07711 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTSLP07711 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSLP07711 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSLP07711 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSLP07711 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSLP07711 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTSLP07711 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSLP07711 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTSLP07711 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSLP07711 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CTSLP07711 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTSLP07711 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTSLP07711 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTSLP07711 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSLP07711 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTSLP07711 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTSLP07711 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTSLP07711 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSLP07711 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CTSLP07711 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSLP07711 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTSLP07711 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSLP07711 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSLP07711 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTSLP07711 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSLP07711 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTSLP07711 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSLP07711 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTSLP07711 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSLP07711 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTSLP07711 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms