Protein–RNA interactions for Protein: P06858

LPL, Lipoprotein lipase, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPLP06858 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LPLP06858 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LPLP06858 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LPLP06858 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LPLP06858 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LPLP06858 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LPLP06858 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LPLP06858 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LPLP06858 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LPLP06858 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LPLP06858 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LPLP06858 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LPLP06858 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LPLP06858 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LPLP06858 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LPLP06858 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LPLP06858 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LPLP06858 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LPLP06858 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LPLP06858 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LPLP06858 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LPLP06858 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LPLP06858 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LPLP06858 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LPLP06858 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LPLP06858 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LPLP06858 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LPLP06858 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LPLP06858 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LPLP06858 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LPLP06858 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPLP06858 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPLP06858 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPLP06858 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPLP06858 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPLP06858 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPLP06858 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPLP06858 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPLP06858 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPLP06858 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPLP06858 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPLP06858 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPLP06858 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPLP06858 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPLP06858 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPLP06858 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPLP06858 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPLP06858 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPLP06858 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPLP06858 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPLP06858 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPLP06858 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPLP06858 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPLP06858 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPLP06858 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPLP06858 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPLP06858 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPLP06858 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPLP06858 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPLP06858 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPLP06858 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPLP06858 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LPLP06858 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPLP06858 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPLP06858 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPLP06858 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPLP06858 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPLP06858 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPLP06858 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPLP06858 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPLP06858 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPLP06858 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LPLP06858 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPLP06858 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPLP06858 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPLP06858 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPLP06858 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPLP06858 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPLP06858 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPLP06858 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPLP06858 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LPLP06858 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPLP06858 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPLP06858 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPLP06858 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPLP06858 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPLP06858 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPLP06858 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPLP06858 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPLP06858 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPLP06858 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPLP06858 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPLP06858 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPLP06858 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPLP06858 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LPLP06858 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LPLP06858 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LPLP06858 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LPLP06858 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LPLP06858 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms