Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms