Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGAP02671 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGAP02671 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGAP02671 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGAP02671 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGAP02671 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGAP02671 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGAP02671 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGAP02671 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGAP02671 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGAP02671 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGAP02671 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGAP02671 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGAP02671 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGAP02671 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGAP02671 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGAP02671 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGAP02671 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGAP02671 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGAP02671 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGAP02671 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGAP02671 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGAP02671 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FGAP02671 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FGAP02671 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGAP02671 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGAP02671 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGAP02671 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGAP02671 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGAP02671 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGAP02671 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGAP02671 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGAP02671 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGAP02671 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGAP02671 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGAP02671 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGAP02671 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGAP02671 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGAP02671 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGAP02671 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGAP02671 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGAP02671 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGAP02671 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGAP02671 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGAP02671 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGAP02671 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGAP02671 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGAP02671 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGAP02671 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGAP02671 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGAP02671 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGAP02671 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGAP02671 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGAP02671 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGAP02671 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGAP02671 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGAP02671 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGAP02671 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGAP02671 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGAP02671 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGAP02671 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGAP02671 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGAP02671 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGAP02671 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGAP02671 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGAP02671 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGAP02671 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FGAP02671 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGAP02671 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGAP02671 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGAP02671 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGAP02671 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGAP02671 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGAP02671 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGAP02671 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGAP02671 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGAP02671 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGAP02671 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGAP02671 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGAP02671 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGAP02671 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGAP02671 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGAP02671 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGAP02671 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGAP02671 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGAP02671 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGAP02671 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGAP02671 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGAP02671 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGAP02671 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGAP02671 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGAP02671 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGAP02671 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGAP02671 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGAP02671 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGAP02671 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGAP02671 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGAP02671 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGAP02671 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGAP02671 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms