Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NSD2O96028 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NSD2O96028 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NSD2O96028 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NSD2O96028 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NSD2O96028 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NSD2O96028 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NSD2O96028 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NSD2O96028 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NSD2O96028 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NSD2O96028 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NSD2O96028 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NSD2O96028 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NSD2O96028 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NSD2O96028 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NSD2O96028 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NSD2O96028 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NSD2O96028 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
NSD2O96028 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NSD2O96028 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NSD2O96028 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NSD2O96028 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NSD2O96028 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NSD2O96028 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NSD2O96028 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NSD2O96028 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NSD2O96028 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NSD2O96028 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NSD2O96028 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NSD2O96028 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NSD2O96028 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NSD2O96028 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NSD2O96028 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NSD2O96028 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NSD2O96028 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NSD2O96028 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NSD2O96028 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NSD2O96028 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NSD2O96028 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NSD2O96028 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NSD2O96028 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NSD2O96028 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NSD2O96028 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NSD2O96028 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NSD2O96028 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NSD2O96028 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NSD2O96028 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NSD2O96028 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NSD2O96028 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NSD2O96028 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NSD2O96028 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NSD2O96028 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NSD2O96028 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NSD2O96028 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NSD2O96028 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NSD2O96028 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NSD2O96028 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NSD2O96028 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NSD2O96028 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NSD2O96028 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NSD2O96028 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NSD2O96028 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NSD2O96028 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NSD2O96028 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NSD2O96028 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NSD2O96028 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NSD2O96028 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NSD2O96028 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NSD2O96028 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NSD2O96028 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NSD2O96028 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NSD2O96028 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NSD2O96028 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NSD2O96028 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NSD2O96028 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NSD2O96028 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NSD2O96028 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NSD2O96028 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NSD2O96028 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NSD2O96028 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NSD2O96028 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NSD2O96028 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NSD2O96028 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NSD2O96028 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NSD2O96028 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NSD2O96028 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NSD2O96028 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NSD2O96028 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NSD2O96028 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NSD2O96028 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NSD2O96028 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NSD2O96028 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NSD2O96028 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NSD2O96028 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NSD2O96028 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NSD2O96028 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NSD2O96028 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NSD2O96028 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NSD2O96028 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NSD2O96028 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms