Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
APBA3O96018 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
APBA3O96018 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
APBA3O96018 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
APBA3O96018 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APBA3O96018 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
APBA3O96018 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
APBA3O96018 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
APBA3O96018 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APBA3O96018 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APBA3O96018 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
APBA3O96018 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APBA3O96018 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
APBA3O96018 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.55■■■□□ 2
APBA3O96018 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APBA3O96018 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.55■■■□□ 2
APBA3O96018 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
APBA3O96018 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
APBA3O96018 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APBA3O96018 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APBA3O96018 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APBA3O96018 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APBA3O96018 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
APBA3O96018 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
APBA3O96018 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
APBA3O96018 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
APBA3O96018 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APBA3O96018 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.54■■■□□ 2
APBA3O96018 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APBA3O96018 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APBA3O96018 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
APBA3O96018 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
APBA3O96018 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APBA3O96018 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
APBA3O96018 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.53■■■□□ 2
APBA3O96018 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
APBA3O96018 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APBA3O96018 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
APBA3O96018 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
APBA3O96018 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
APBA3O96018 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APBA3O96018 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APBA3O96018 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APBA3O96018 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APBA3O96018 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.52■■■□□ 2
APBA3O96018 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APBA3O96018 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.52■■■□□ 2
APBA3O96018 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
APBA3O96018 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
APBA3O96018 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.52■■■□□ 2
APBA3O96018 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APBA3O96018 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APBA3O96018 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
APBA3O96018 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APBA3O96018 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
APBA3O96018 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
APBA3O96018 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
APBA3O96018 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
APBA3O96018 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
APBA3O96018 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APBA3O96018 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APBA3O96018 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APBA3O96018 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
APBA3O96018 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
APBA3O96018 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APBA3O96018 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
APBA3O96018 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APBA3O96018 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APBA3O96018 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APBA3O96018 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
APBA3O96018 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
APBA3O96018 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APBA3O96018 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APBA3O96018 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APBA3O96018 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APBA3O96018 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
APBA3O96018 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
APBA3O96018 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
APBA3O96018 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APBA3O96018 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APBA3O96018 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APBA3O96018 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APBA3O96018 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
APBA3O96018 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
APBA3O96018 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
APBA3O96018 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
APBA3O96018 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
APBA3O96018 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
APBA3O96018 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
APBA3O96018 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
APBA3O96018 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
APBA3O96018 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
APBA3O96018 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
APBA3O96018 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APBA3O96018 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APBA3O96018 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
APBA3O96018 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
APBA3O96018 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
APBA3O96018 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APBA3O96018 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms