Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAPLNO95428 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAPLNO95428 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAPLNO95428 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAPLNO95428 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPLNO95428 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms