Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms