Protein–RNA interactions for Protein: O95395

GCNT3, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT3O95395 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GCNT3O95395 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNT3O95395 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms