Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms