Protein–RNA interactions for Protein: O75781

PALM, Paralemmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMO75781 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALMO75781 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALMO75781 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALMO75781 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALMO75781 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALMO75781 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALMO75781 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALMO75781 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALMO75781 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALMO75781 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALMO75781 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALMO75781 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALMO75781 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALMO75781 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALMO75781 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALMO75781 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PALMO75781 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALMO75781 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALMO75781 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALMO75781 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALMO75781 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALMO75781 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALMO75781 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALMO75781 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALMO75781 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALMO75781 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALMO75781 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALMO75781 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALMO75781 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALMO75781 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALMO75781 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALMO75781 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALMO75781 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALMO75781 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PALMO75781 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PALMO75781 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALMO75781 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALMO75781 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALMO75781 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALMO75781 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALMO75781 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALMO75781 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALMO75781 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALMO75781 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALMO75781 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALMO75781 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PALMO75781 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALMO75781 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALMO75781 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALMO75781 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALMO75781 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALMO75781 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALMO75781 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALMO75781 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALMO75781 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALMO75781 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALMO75781 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALMO75781 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALMO75781 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALMO75781 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALMO75781 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALMO75781 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALMO75781 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALMO75781 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALMO75781 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALMO75781 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALMO75781 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PALMO75781 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALMO75781 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALMO75781 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALMO75781 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALMO75781 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALMO75781 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALMO75781 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALMO75781 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PALMO75781 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALMO75781 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALMO75781 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALMO75781 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALMO75781 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALMO75781 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALMO75781 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALMO75781 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALMO75781 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALMO75781 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALMO75781 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALMO75781 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALMO75781 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PALMO75781 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALMO75781 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PALMO75781 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALMO75781 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALMO75781 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALMO75781 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALMO75781 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALMO75781 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALMO75781 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALMO75781 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALMO75781 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALMO75781 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms