Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCATO75600 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCATO75600 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCATO75600 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCATO75600 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCATO75600 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GCATO75600 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCATO75600 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GCATO75600 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCATO75600 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCATO75600 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCATO75600 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCATO75600 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCATO75600 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GCATO75600 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCATO75600 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCATO75600 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCATO75600 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCATO75600 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCATO75600 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCATO75600 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCATO75600 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCATO75600 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCATO75600 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GCATO75600 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCATO75600 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCATO75600 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCATO75600 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCATO75600 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCATO75600 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCATO75600 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCATO75600 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCATO75600 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCATO75600 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCATO75600 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GCATO75600 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GCATO75600 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCATO75600 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCATO75600 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCATO75600 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCATO75600 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCATO75600 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCATO75600 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCATO75600 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCATO75600 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCATO75600 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCATO75600 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCATO75600 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCATO75600 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCATO75600 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCATO75600 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCATO75600 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCATO75600 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCATO75600 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCATO75600 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCATO75600 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCATO75600 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCATO75600 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GCATO75600 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCATO75600 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCATO75600 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCATO75600 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCATO75600 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCATO75600 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCATO75600 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCATO75600 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCATO75600 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCATO75600 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCATO75600 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCATO75600 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCATO75600 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCATO75600 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCATO75600 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCATO75600 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GCATO75600 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCATO75600 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GCATO75600 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCATO75600 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCATO75600 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCATO75600 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCATO75600 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCATO75600 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCATO75600 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCATO75600 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCATO75600 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCATO75600 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCATO75600 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCATO75600 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCATO75600 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCATO75600 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCATO75600 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCATO75600 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCATO75600 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCATO75600 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GCATO75600 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GCATO75600 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCATO75600 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCATO75600 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCATO75600 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCATO75600 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms