Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSDE1O75534 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSDE1O75534 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSDE1O75534 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSDE1O75534 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSDE1O75534 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSDE1O75534 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CSDE1O75534 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CSDE1O75534 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSDE1O75534 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CSDE1O75534 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSDE1O75534 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CSDE1O75534 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSDE1O75534 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CSDE1O75534 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSDE1O75534 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSDE1O75534 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSDE1O75534 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSDE1O75534 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSDE1O75534 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSDE1O75534 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSDE1O75534 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSDE1O75534 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSDE1O75534 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSDE1O75534 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSDE1O75534 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSDE1O75534 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSDE1O75534 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSDE1O75534 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSDE1O75534 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSDE1O75534 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CSDE1O75534 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms