Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN5O75503 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN5O75503 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN5O75503 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN5O75503 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN5O75503 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN5O75503 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN5O75503 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN5O75503 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN5O75503 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN5O75503 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN5O75503 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN5O75503 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN5O75503 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN5O75503 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN5O75503 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN5O75503 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN5O75503 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN5O75503 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN5O75503 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN5O75503 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN5O75503 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN5O75503 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN5O75503 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN5O75503 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN5O75503 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN5O75503 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN5O75503 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN5O75503 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN5O75503 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN5O75503 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN5O75503 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN5O75503 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN5O75503 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN5O75503 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN5O75503 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN5O75503 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN5O75503 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN5O75503 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN5O75503 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN5O75503 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN5O75503 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN5O75503 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN5O75503 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN5O75503 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN5O75503 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN5O75503 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN5O75503 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN5O75503 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN5O75503 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN5O75503 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN5O75503 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN5O75503 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN5O75503 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN5O75503 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN5O75503 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN5O75503 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN5O75503 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN5O75503 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN5O75503 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN5O75503 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN5O75503 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN5O75503 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN5O75503 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN5O75503 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN5O75503 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN5O75503 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN5O75503 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN5O75503 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN5O75503 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN5O75503 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN5O75503 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN5O75503 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN5O75503 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN5O75503 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN5O75503 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN5O75503 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN5O75503 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN5O75503 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN5O75503 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN5O75503 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN5O75503 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN5O75503 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN5O75503 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN5O75503 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN5O75503 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN5O75503 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN5O75503 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN5O75503 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN5O75503 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN5O75503 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN5O75503 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN5O75503 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN5O75503 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN5O75503 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN5O75503 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN5O75503 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN5O75503 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN5O75503 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN5O75503 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms